FMF and WeightedPath issues with complex and large molecules #672
Description
The molecules listed below have trouble with FMF (Complexity of a molecule; FMFDescriptorTest.java) and WeightedPath (Characterize molecular branching; WeightedPathDescriptorTest.java) descriptors. They are valid SMILES and descriptors, but quite complex, good for unit testing (but not recommended due to computational time). Some of them do not calculate after several minutes or at all, while most other CDK descriptors finish within seconds. So FMF and WeightedPath have issues with larger complex molecules.
C[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O1)OC[C@@H]2[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O2)OC(=O)[C@]34CCC(C[C@H]3C5=CCC6[C@]7(CC[C@@H](C(C7CC[C@]6([C@@]5(C[C@H]4O)C)C)(C)C)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O8)CO[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@H](CO9)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O)O)O)O)C)(C)C)O[C@H]1[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O1)C)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O
C[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@H]2OC(=O)[C@]34CCC(C[C@H]3C5=CCC6[C@]7(CC[C@@H](C(C7CC[C@]6([C@@]5(C[C@H]4O)C)C)(C)C)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O8)CO[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@H](CO9)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O)O)O)O)C)(C)C)CO)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O)O
C/C=C(/C)\C(=O)O[C@H]1[C@@H](C(CC2[C@@]13[C@@H](C[C@@]4([C@@]2(CCC5[C@]4(CCC6[C@@]5(CC[C@@H](C6(C)C)O[C@H]7[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O7)C(=O)O)O)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O8)CO)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O9)C)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)C)C)O[C@H]3O)C)O)(C)C)OC(=O)/C(=C\C)/C
C[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@H]2O[C@H]3CC[C@]4(C(C3(C)C)CC[C@@]5(C4CC=C6[C@]5(C[C@H]([C@@]7([C@H]6CC(CC7)(C)C)C(=O)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@H](CO8)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O9)C)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)O)O)O)C)C)C)CO)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O)O)O)O)O
C[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@@H]([C@H](O1)O[C@H]2[C@@H](CO[C@H]([C@@H]2O)O[C@H]3[C@@H](O[C@H]([C@@H]([C@@H]3O[C@H]4[C@@H]([C@](CO4)(CO)O)O)O)O[C@@H]5[C@H]([C@H](CO[C@H]5OC(=O)[C@@]67CC[C@@]8(C(=CCC9[C@]8(C[C@H](C1[C@@]9(C[C@H]([C@H]([C@@]1(C)CO)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)O)C)O)C)[C@@H]6CC(CC7)(C)C)C)O)O)C)O)O)O)O
C[C@@H]1CC[C@@]2([C@H]([C@H]3[C@@H](O2)[C@H]([C@@H]4[C@@]3(CC[C@H]5[C@H]4CC[C@@H]6[C@@]5(C[C@H]([C@@H](C6)O[C@H]7[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O7)CO)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O8)CO)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@@H](CO9)O)O)O)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O2)CO)O)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)O)O)O)O)O)C)C)O)C)OC1
C[C@@H]1[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O1)OC(=O)[C@]23CCC(C[C@H]2C4=CCC5[C@]6(CC[C@@H]([C@@](C6CC[C@]5([C@@]4(C[C@H]3O)C)C)(C)C=O)O[C@H]7[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O7)C(=O)O)O)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H](CO8)O)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O9)CO)O)O)O)C)(C)C)OC1C(C(C(C(O1)CO)O)O)O)O)OC1C(C(C(C(O1)C)OC1C(C(C(CO1)O)O)O)O)O
C[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@H]2O[C@H]3CC[C@]4(C(C3(C)C)CC[C@@]5(C4CC=C6[C@]5(CC[C@@]7([C@H]6CC(CC7)(C)C)C(=O)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@H](CO8)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O9)C)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)O)O)C)C)C)CO)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O)O)O)O)O
C[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2[C@H]([C@H](CO[C@H]2OC(=O)[C@]34CCC(C[C@H]3C5=CCC6[C@]7(C[C@@H]([C@@H]([C@@](C7[C@@H](C[C@]6([C@@]5(C[C@H]4O)C)C)O)(C)CO)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O8)CO)O[C@@H]9[C@@H]([C@](CO9)(CO)O)O)O)O)O)C)(C)C)O)O)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O[C@H]1[C@@H]([C@](CO1)(CO)O)O)O
C[C@@H]1[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O1)OC(=O)[C@]23CCC(C[C@H]2C4=CCC5[C@]6(CC[C@@H]([C@@](C6CC[C@]5([C@@]4(C[C@H]3O)C)C)(C)C=O)O[C@H]7[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O7)C(=O)O)O)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H](CO8)O)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O9)CO)O)O)O)C)(C)C)O)OC1C(C(C(C(O1)C)O)O)O)OC1C(C(C(C(O1)C)OC1C(C(C(CO1)O)O)O)O)O
C/C=C(/C)\C(=O)O[C@H]1CC(CC2[C@@]13[C@@H](C[C@@]4([C@@]2(CCC5[C@]4(CCC6[C@@]5(CC[C@@H](C6(C)C)O[C@H]7[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O7)C(=O)O)O)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O8)CO)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O9)C)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@](CO1)(CO)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)C)C)O[C@H]3O)C)O)(C)C
C[C@]12CC[C@@H]([C@@](C1CC[C@@]3(C2CC=C4[C@]3(C[C@H]([C@@]5([C@H]4CC(CC5)(C)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO[C@H]7[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O7)CO[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O8)CO)O)O)O)O)O)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O9)CO)O)O)O)O)O)C)C)(C)C(=O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H](CO1)O)O)O
C[C@H]1[C@H]2[C@H](CC3[C@@]2(CCC4[C@H]3CC=C5[C@@]4(CC[C@@H](C5)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O[C@H]7[C@@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O7)C)O)O)O)O)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O8)CO)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O9)CO)O)O)O)O)C)C)O[C@]11CC[C@@](O1)(C)CO[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O
CC(=O)O[C@H]1CC(CC2[C@]13CO[C@@]24CCC5[C@]6(CC[C@@H]([C@@](C6CC[C@]5([C@@]4(C[C@H]3O)C)C)(C)CO)O[C@H]7[C@@H]([C@H]([C@H](CO7)O[C@H]8[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O8)CO)O)O)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@@H](CO9)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)O)O)O)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)C)(C)C
C[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@H](O[C@H]2O[C@H]3[C@@H]([C@H](O[C@H]([C@@H]3O[C@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O4)CO)O[C@H]5[C@@H]([C@H]([C@@H](CO5)O)O)O)O)O)O[C@H]6CC[C@@]7(C8CC[C@@]91C2CC(CC[C@]2(CO9)[C@@H](C[C@]1([C@@]8(CCC7C6(C)C)C)C)O)(C)C)C)C(=O)O)O)CO)O)O)O)O)O
C[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2[C@H](O[C@H]([C@@H]([C@H]2O)O)OC[C@@H]3[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O3)OC(=O)[C@@]45CC[C@@]6(C(=CCC7[C@]6(CCC8[C@@]7(C[C@@H]([C@@H]([C@@]8(C)C(=O)O)O)OC(=O)C)C)C)[C@@H]4CC(CC5)(C)C)C)O[C@H]9[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O9)CO)O)O)O)O)O)CO)O)O)O